Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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FXNQ16595 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FXNQ16595 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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