Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC18A3Q16572 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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