Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
E2F4Q16254 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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