Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ATP6AP1Q15904 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATP6AP1Q15904 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms