Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCOA1Q15788 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCOA1Q15788 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
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