Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF13Q15543 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF13Q15543 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TAF13Q15543 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TAF13Q15543 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TAF13Q15543 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TAF13Q15543 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TAF13Q15543 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms