Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PCM1Q15154 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PCM1Q15154 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms