Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLCA4Q14CN2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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