Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GBX1Q14549 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
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GBX1Q14549 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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GBX1Q14549 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GBX1Q14549 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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