Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SPTAN1Q13813 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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