Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDH18Q13634 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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