Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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CUL3Q13618 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL3Q13618 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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