Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PPP1R1AQ13522 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PPP1R1AQ13522 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms