Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TCIRG1Q13488 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TCIRG1Q13488 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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