Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TYW3-205ENST00000479111 1130 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC087273.2-201ENST00000519038 634 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZNF506-204ENST00000545006 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC103996.2-201ENST00000556763 915 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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MKRN4PQ13434 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC137794.1-201ENST00000509185 914 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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MKRN4PQ13434 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC004918.3-201ENST00000602609 925 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MKRN4PQ13434 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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