Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SP140Q13342 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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SP140Q13342 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SP140Q13342 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SP140Q13342 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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