Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLN3Q13286 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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