Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALCOCO2Q13137 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CALCOCO2Q13137 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms