Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CHAF1BQ13112 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CHAF1BQ13112 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CHAF1BQ13112 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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