Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRIM32Q13049 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms