Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXF2Q12947 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXF2Q12947 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms