Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RASGEF1BQ0VAM2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RASGEF1BQ0VAM2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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