Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYP4F3Q08477 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYP4F3Q08477 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms