Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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TFF3Q07654 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TFF3Q07654 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TFF3Q07654 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TFF3Q07654 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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