Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SOX4Q06945 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms