Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LTBQ06643 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms