Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
REG3AQ06141 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms