Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CREMQ03060 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CREMQ03060 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CREMQ03060 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CREMQ03060 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms