Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MC1RQ01726 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MC1RQ01726 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms