Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MS4A2Q01362 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms