Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
B4GALNT1Q00973 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms