Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC42EP1Q00587 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms