Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK3Q00526 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms