Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ELF3P78545 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELF3P78545 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF3P78545 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF3P78545 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELF3P78545 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms