Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms