Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
HERVK_113P63121 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
HERVK_113P63121 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms