Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RAB4BP61018 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms