Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCBP4P57723 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCBP4P57723 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms