Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PRKAG1P54619 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms