Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SMARCA2P51531 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SMARCA2P51531 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms