Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TAF6P49848 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TAF6P49848 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TAF6P49848 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms