Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GRIA2P42262 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIA2P42262 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms