Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGAEP38570 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms