Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD13P35453 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms