Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ABCC1P33527 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms