Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CRABP1P29762 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CRABP1P29762 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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