Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GJB2P29033 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GJB2P29033 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GJB2P29033 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GJB2P29033 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms