Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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HOXD10P28358 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD10P28358 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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