Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ABCD3P28288 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms