Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LMO2P25791 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMO2P25791 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
LMO2P25791 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LMO2P25791 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LMO2P25791 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms